Il progetto APICE sviluppa le sue azioni su 5 diverse aree di studio situate in 4 paesi MED appartenenti rispettivamente alle seguenti regioni:
Inoltre, il progetto coinvolge alcune delle più importanti città portuali presenti nell'area del Mediterraneo.
Le aree coinvolte nel progetto mostrano caratteristiche comuni legate ai sistemi delle aree portuali (in termini di organizzazione industriale del distretto portuale) e presentano gli stessi problemi di inquinamento atmosferico, i quali incidono gravemente non solo sulla densità di popolazione dei centri urbani, ma anche sull'intero complesso degli ecosistemi naturali e del patrimonio culturale (i territori coinvolti nel progetto contano diversi siti di importanza comunitaria e zone di protezione speciale nelle loro funzioni, così come i siti UNESCO).